Stanje pomanjkanja ščitničnega hormona, ki je prisotna ob rojstvu. Približno 1 v 4000 novorojenčkih je hudo pomanjkanje delovanje ščitnice, še bolj pa blag ali delno stopinj. , Če ne zdravimo več mesecev po rojstvu, prirojeni hipotiroidizem lahko privede do prizadetosti trajne duševne zaostalosti in nenormalno rast. V Združenih državah Amerike in mnogih drugih državah, so vseh novorojenčkov testira prirojenimi hypothyroidism. , Če se zdravljenje začne v prvem mesecu po rojstva, dojenčkov običajno normalno razvija.

Zdravljenje običajno sestavljena dnevni odmerek ščitničnih hormonov (tiroksina) skozi usta. Ker zdravljenje je preprosto, učinkovito in poceni, skoraj vse novorojenčka razvitem svetu praks presejanja za odkrivanje in zdravljenje prirojene hipotiroidizem v prvih tednih življenja.