Obliki VNTR (q.v.). Posebej, segment DNK značilna pojav spremenljivo število kopij (od nekaj do 30 ali tako) zaporedje okoli 5 ali manj osnov (imenovano ponovite enota, q.v.). A tipičen microsatellite je ponovitev enoto AC, ki se pojavi pri približno 100 000 različnih mestih v tipično sesalcev genoma. Pri katerikoli eno (locus), so ponavadi več različnih "alelov," vsak določljiva glede na število ponovitev enot. Teh alelov lahko zaznajo PCR (q.v.), z uporabo začetnih oligonukleotidov, izdelani iz enoznačen niz, ki se nahaja na obeh straneh na microsatellite. Ko je PCR izdelka je steči elektroforetskimi gel, alelov pojmujejo razlikujejo po dolžini v enotah enako velikost ponovite enote, npr., če oligonukleotidnih ustrezajo enoznačen niz takoj na obeh straneh se microsatellite in vsak 20 baz dolgo in je posameznik heterozigotna za AC microsatellite z enega alela, ki obsega 5 ponavlja in drugi, ki obsega 6 ponavlja, v heterocigotni bo razstava dveh pasov na gelu, en band pa 20 + (2 × 5) + 20 = 50 baze long in drugih alelov pa 20 + (2 x 6) + 20 = 52 baz dolgo. Mikrosateliti so bili standardni DNK označevalca: so enostavno zaznati s PCR, in so ponavadi enakomerno nahajajo po vsej genoma. Tisoč so bili locirani v veliko različnih vrst.